Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxrgP28705 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxrgP28705 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms