Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms