Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Clstn1Q9EPL2 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Clstn1Q9EPL2 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Clstn1Q9EPL2 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Clstn1Q9EPL2 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Clstn1Q9EPL2 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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