Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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