Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp1Q8BJQ2 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp1Q8BJQ2 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp1Q8BJQ2 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp1Q8BJQ2 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp1Q8BJQ2 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms