Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NischQ80TM9 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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