Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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