Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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