Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PdgfraP26618 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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PdgfraP26618 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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PdgfraP26618 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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PdgfraP26618 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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