Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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P10404 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
P10404 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
P10404 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
P10404 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
P10404 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
P10404 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
P10404 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
P10404 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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