Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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H2-Eb1P04230 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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