Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms