Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Clrn2B2RVW2 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Clrn2B2RVW2 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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