Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms