Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms