Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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