Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Prpf39Q8K2Z2 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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