Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Snx8Q8CFD4 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms