Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Ubash3bQ8BGG7 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms