Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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