Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Klhdc9Q3USL1 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms