Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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