Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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Rnf149Q3U2C5 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Rnf149Q3U2C5 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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Rnf149Q3U2C5 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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Rnf149Q3U2C5 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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Rnf149Q3U2C5 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Rnf149Q3U2C5 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Rnf149Q3U2C5 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rnf149Q3U2C5 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rnf149Q3U2C5 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Rnf149Q3U2C5 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnf149Q3U2C5 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnf149Q3U2C5 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnf149Q3U2C5 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnf149Q3U2C5 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnf149Q3U2C5 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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