Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ctdnep1Q3TP92 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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