Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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