Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgcdP82347 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms