Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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