Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gli1P47806 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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