Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprmP28828 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms