Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms