Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms