Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MesdQ9ERE7 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms