Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms