Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CipcQ8R0W1 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CipcQ8R0W1 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CipcQ8R0W1 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms