Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Usp27Q8CEG8 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Usp27Q8CEG8 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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Usp27Q8CEG8 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Usp27Q8CEG8 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Usp27Q8CEG8 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Usp27Q8CEG8 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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