Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NischQ80TM9 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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