Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccdc88cQ6VGS5 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccdc88cQ6VGS5 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccdc88cQ6VGS5 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccdc88cQ6VGS5 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms