Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd13P70217 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms