Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms