Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms