Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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