Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms