Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Hoxd9P28357 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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Hoxd9P28357 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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Hoxd9P28357 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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