Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms