Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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