Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms