Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms