Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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