Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Rnf4Q9QZS2 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Rnf4Q9QZS2 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Rnf4Q9QZS2 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rnf4Q9QZS2 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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