Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OtofQ9ESF1 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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